НИИЭМ  


telephone
  2gisг. Владивосток, Сельская, 1

 
img
 

 

Главная страница

Научно-организационная
деятельность

Интеллектуальная
собственность

Образовательная
деятельность

Инновационная
деятельность

Дополнительные виды
деятельности

Официальные документы

Контакты

Вакансии

 

 

 

Лабратория молекулярной эпидемиологии и экологии патогенных бактерий

         Руководитель лаборатории - Яковлев Анатолий Александрович,Яковлев А.А.
ведущий научный сотрудник, доктор медицинских наук, профессор.

 

 

 

 

Телефон: 8 (423) 244-14-88,
e-mail: yakovlev-epid@yandex.ru

 

        Лаборатория экологии патогенных бактерий организована в 1989 г. Первым руководителем лаборатории был академик РАМН Георгий Павлович Сомов. В 1990-2000-е годы Г.П.Сомов определилил путь к развитию учения о сапрозоонозах и под его руководством было развернуто новое направление исследований - изучение экологии внеорганизменных популяций возбудителей сапрозоонозов (Г.П.Сомов, Л.С.Бузолева, Н.Ф.Тимченко, В.Е. Терехова, И.А Беленева., М.Л. Сидоренко). Были раскрыты некоторые эколого-биохимические механизмы адаптации патогенных бактерий при переходе из теплокровного организма в окружающую среду, обосновано значение окружающей среды в качестве резервуара возбудителей сапрозоонозов. Лаборатория имеет прочные научные связи как с отечественными, так и с зарубежными коллегами. Курируется работа НОЦ института «Молекулярная микробиология, иммунология, эпидемиология, иммунопатогенез и диагностика инфекционных болезней».

Сотрудники лаборатории

Раков Алексей Владимирович - старший научный сотрудник, кандидат медицинских наук, e-mail: vokar@mail333.com
Кузнецова Наталья Анатольевна - старший научный сотрудник, кандидат медицинских наук, e-mail: kuznetsovanata@mail.ru
Пономарева Анна Леонидовна - научный сотрудник, e-mail: giston@list.ru
Еськова Алена Игоревна - младший научный сотрудник, e-mail: gosha30245@mail.ru
Белкина Раиса Анатольевна - лаборант-исследователь.
Фатеева Людмила Николаевна - лаборант-исследователь.
Тарабанова Светлана Ивановна - лаборант-исследователь.
Обухова Вера Степановна - лаборант-исследователь.
Фадеева Ирина Васильевна - лаборант.

Основные направления научных исследований

  1. Изучение механизмов адаптации возбудителей сапрозоонозов к абиотическим факторам окружающей среды, включающее  исследование  биологических свойств и генетической структуры популяций возбудителей сапрозоонозов   в условиях антропогенного загрязнения эндемичных территорий, и биотическим факторам в направлении  исследования действия регуляторных сигналов на размножение патогенных бактерий в процессах межклеточной коммуникации.
  2. Изучение механизмов циркуляции возбудителя листериоза на территории Дальнего Востока, выявление новых генетических вариантов  возбудителя листериоза, имеющих эпидемиологическое и эпизоотологическое значение.
  3. Усовершенствование лабораторной диагностики  сапрозоонозов на основе разработок новых  тест-систем, дифференциально-диагностических ипитательных сред  с  использованием дальневосточного сырья.

        Решен ряд вопросов, связанных с экологией возбудителей сапрозоонозов и закономерностями эпидемического процесса через раскрытие некоторых адаптационных биохимических механизмов, сформировавшихся у Yersiniapseudotuberculosis   и Listeriamonocytogenes, в процессе адаптации популяций этих патогенных бактерий к изменяющимся условиям окружающей среды. Показано, что популяционная изменчивость возбудителей сапрозоонозов  является адаптивной реакцией бактерий при смене сред обитания и носит фенотипический характер, что позволяет им сохраняться как биологическим видам в разных условиях обитания.
        Разработана комплексная система микробиологического и молекулярно-генетичес-кого мониторинга за возбудителем листериоза, L.monocytogenes, включающая: экспресс-методы выявления и идентификации возбудителя листериоза, основанные на ПЦР, специфичной в отношении консервативных фрагментов генов патогенности, кодирующих белки-интерналины, использование адаптированных и оптимизированных для отечественных условий методов микробиологической дифференциациилистерий и систему типирования L.monocytogenes на основе мультилокусного секвенирования генов факторов патогенности. Разработанная система позволяет дифференцировать эпидемически несвязанные между собой изоляты листерий и  обеспечивать проведение систематического анализа и прогнозирование заболеваемости этой инфекцией.
        За годы работы лаборатории были выполнены и защищены 2 докторские и 7 кандидатских диссертаций, опубликовано 10 монографий, получено 2 авторских свидетельства и 7 патентов на изобретения.

На договорной основе в лаборатории выполняются:

  • Бактериологическая диагностика псевдотуберкулеза, листериоза, урогенитальных  инфекций  (уреаплазмоза,  микоплазмоза,  гарднереллеза).
  • Бактериоскопическая диагностика трихомониаза, гонорреи, гарднереллеза,  хламидиоза.
  • Определение чувствительности к антибиотикам  штаммов уреаплазм, микоплазм, листерий, иерсиний.
  • Мониторинговые исследования санитарно-микробиологического состояния морских вод и почв
  • Мониторинговые исследования эколого-микробиологического состояния сред обитания на основе сравнительных исследований численности бактерий разных физиологических групп.
  • Консультативно-методическая помощь.

Докторские диссертации

1. Бузолева Л.С. «Адаптация патогенных бактерий к абиотическим факторам окружающей среды»: Владивосток, 2001.
2. Зайцева Е.А. «Система анализа микробиологических и молекулярно-генетичес-ких маркеров для выявления высоковирулентных штаммов Listeria monocytogenes»: Москва, 2010.

Кандидатские диссертации

1. Бузолева Л.С. «Бифазные бентонитовые среды для диагностики кишечных инфекций»:  Владивосток, 1990.
2. Беленева И.А. «Психрофильность Listeria monocytogenesи ее эколого-эпидемиологическое значение:  Владивосток, 1996.
3. Кузьмин А.В. «Микробиологические и эпидемиологические особенности псевдотуберкулеза в Приморском крае в современный период»: Владивосток, 1997.
4. Терехова В.Е. «Микробиологические аспекты экологии листерий в морской среде»: Владивосток, 2002.
5. Сидоренко М.Л. « Влияние абиотических  и биотических  факторов почвенных экосистем на рост и размножение  патогенной микрофлоры »: Владивосток, 2004.
6. Исаченко А.С. «Ультраструктурная адаптация внеорганизменных популяций патогенных бактерий к условиям естественной и модельной экосистем»: Владивосток, 2004
7. Цветкова Н. Б. «Влияние факторов среды на биологические     свойства Listeria monocytogenes ,  контаминирующих пищевые продукты: Владивосток,  2011.

Монографии

  • Сомов Г.П. Дальневосточная скарлатиноподобная лихорадка. М., Медицина, 1979.
  • Сомов Г.П., Беседнова Н.Н., Дзадзиева М.Ф., Тимченко Н.Ф. Иммунология псевдотуберкулеза. Новосибирск: Наука, 1985.
  • Сомов Г.П., Беседнова Н.Н. Геморрагические лихорадки. Л.: Наука, 1988.
  • Сомов Г.П., Литвин В.Ю. Сапрофитизм и паразитизм патогенных бактерий. Новосибирск: Наука, 1988.
  • Сомов Г.П., Покровский В.И., Беседнова Н.Н. Псевдотуберкулез. М., Медицина, 1990.
  • Сомов Г.П., Варвашевич Т.Н., Тимченко Н.Ф. Психрофильность патогенных бактерий. Новосибирск, Наука, 1992.
  • Сомов Г.П., Покровский В.И., Беседнова Н.Н., Антоненко Ф.И. Псевдотуберкулез М., Медицина, 2000 (2-е издание).
  • Сомов Г.П., Бузолева Л.С. Адаптация патогенных бактерий к абиотическим факторам окружающей среды. Владивосток: Примполиграфкомбинат, 2004.
  • Сомова Л.М., Бузолева Л.С., Плехова Н.Г. Ультраструктура патогенных бактерий в разных экологических условиях. Владивосток: Медицина ДВ, 2009.
  • Федянина Л.Н., Зайцева Е.А., Каленик Т.К.. Листериоз – пищевая «эмерджентная» инфекция.  Некоторые актуальные вопросы изучения. Изд. ТГЭУ, Владивосток, 2009.
  • Sidorenko M. L., Buzoleva L.S. The effect of soil abiotic and biotic factors on the preservation and reproduction of Listeria monocytogenes Глава в монографии «Listeria monocytogenes: food sources, prevalence and management strategies». Ed.: Edmund C. Hambrick. - Nova Science Publishers, New York. 2014 P. 231-264.
  • Сидоренко М.Л. Бузолева Л.С. Адаптация патогенных бактерий к абиотическим и биотическим факторам почв Монография Изд-во: МГУ им. Невельского. Редактор профессор Н.М. Костенков. 2013. 232 с.
  • Бузолева Л.С. Санитарно-микробиологическая оценка и источники микробного загрязнения прибрежных морских вод Глава в монографии «Современное экологическое состояние залива Петра Великого Японского моря», Владивосток, Издательский дом Дальневосточного Федерального ун-та. 2012. 190 с. С. 48-72.

Учебные пособия

  • Бузолева Л.С., Безвербная И.П. Влияние тяжелых металлов на физиологию и морфологию морских микроорганизмов. Атлас, учебное пособие, Владивосток: Изд-во: Дальневост. федерального ун-та, 2012. 72 с.
  • Бузолева Л.С. Микробиологическая оценка качества природных вод, учебное пособие, Владивосток: Из-дат-во МГУ им. Невельского, 2011. 85 с.
  • Бузолева Л.С., Белькова Н.Л. Методики для практических работ по большому микробиоло-гическому практикуму, учебное пособие, Владивосток: Изд-во Морской государственный университет им. Адм. Г.И. Невельского, 2012. 48 с.
  • Бузолева, Л.С., Богатыренко Е.А. Словарь терминов и тестовые задания по микробиоло-гии, учебное пособие, Владивосток: Мор. гос. ун-т, 2014.– 111 с., ISBN 978-5-8343-0922-2CRC Press

Основные статьи

  1. Шубин Ф.Н. Эпидемиологические аспекты псевдотуберкулезной поликлональной инфекции // Журн. микробиол. – 1997. - № 5. – С. 22-25.
  2. Fukushima H., Gomyoda M., Hashimoto N., Takashima I., Shubin F.N. et al. Putative origin of Yersinia pseudotuberculosis in Western Eastern countries. A comparison of restriction endonuclease analysis of virulence plasmids // Zent. bl. Bakteriol. – 1998. – Vol. 288. – P. 93-102.
  3. Шубин Ф.Н., Зайцева Е.А., Беседнова Н.Н. Влияние некоторых фторхинолонов на адгезивные свойства различных плазмидоваров Yersinia pseudotuberculosis // Антибиотики и химиотерапия. – 2000. – т. 45. – № 5. – С. 9-13.
  4. Раков А.В., Шубин Ф.Н., Иванис В.А., Кузнецова Н.А., Ковальчук Н.И., Ревина Г.В., Кошелева Н.Г., Гребенькова Л.К. Сравнительная характеристика сальмонеллеза, вызванного различными плазмидоварами Salmonella enteritidis. // Эпидемиология и инфекционные болезни – 2001. – №5. – С. 50-54.
  5. Fukushima H., Matsuda Y., Seki R., Tsubokura M., Takeda N., Shubin F.N., Paik I.K., Zheng X.B. Geographical heterogeneity between Far Eastern and Western countries in prevalence of the virulence plasmid, the superantigen Yersinia pseudotuberculosis-derived mitogen, and the high-pathogenicity island among Yersinia pseudotuberculosis strains. // J. Clin. Microbiol. – 2001. – Vol. 39. – No. 10 – P. 3541-3547. (http://jcm.asm.org/cgi/content/full/39/10/3541)
  6. Шубин Ф.Н., Ковальчук Н.И., Кузнецова Н.А., Ревина Г.В., Раков А.В. и др. Микробиологический мониторинг за Salmonella enteritidis в Приморском крае. Фенотипическая и плазмидная характеристика возбудителя. // Эпидемиология и инфекционные болезни – 2002. – №1. – С. 36-40.
  7. Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Ковальчук Н.И., Ревина Г.В., Кошелева Н.Г. и др. Микробиологический мониторинг за Salmonella enteritidis в Приморском крае. Характеристика заболеваемости, вызванной различными плазмидоварами микроба в г. Владивостоке. // Эпидемиология и инфекционные болезни – 2002. – №1. – С. 40-43.
  8. Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А., Маслов Д.В., Ананьев В.Ю. Структура популяции Salmonella enteritidis в Приморском крае по данным плазмидного анализа. //
  9. Журн. микробиол. – 2006. – № 3. (Приложение) – С. 28-32. (http://elibrary.ru/item.asp?id=9213419)
  10. Кузнецова Н.А, Шубин Ф.Н., Раков А.В и др. Внутригодовая динамика сальмонеллеза, вызванного гетерогенной популяцией Salmonella enteritidis. // Журн. микробиол. – 2006. – № 3. (Приложение) – С. 32-36. (http://elibrary.ru/item.asp?id=9213420)
  11. Раков А.В., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А. и др. Сравнительный анализ штаммов Salmonella enteritidis, выделенных от больных системной сальмонеллезной инфекцией. //
  12. Журн. микробиол. – 2006. – № 3. (Приложение) – С. 36-39. (http://elibrary.ru/item.asp?id=9213421)
  13. Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Ананьев В.Ю., Раков А.В. и др. Динамика многолетней этиологической значимости различных по происхождению плазмидных типов S. enteritidis в формировании спорадической заболеваемости сальмонеллезом населения Приморского края // Тихоокеанский медицинский журнал. – 2010. - № 4. – С. 12-15. (http://vgmu.ru/files/1766.pdf)
  14. Кузнецова Н.А., Шубин Ф.Н., Раков А.В., Тарасенко Т.Т., Воронок В.М., Смирнова Л.А. Связь вспышечной и спорадической заболеваемости сальмонеллезом по соответствию плазмидных характеристик возбудителей // Тихоокеанский медицинский журнал. – 2010. – № 4. – С. 40-42. (http://vgmu.ru/files/1773.pdf)
  15. Кузнецова Н.А., Шубин Ф.Н., Раков А.В. и др. Вспышки сальмонеллеза в Сибири и на Дальнем Востоке // Дальневосточный журнал медицинской патологии. – 2010. – № 17. – С. 137-142. (http://elibrary.ru/item.asp?id=15276164)
  16. Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Раков А.В. и др. Плазмидная характеристика популяции Salmonella enteritidis в Хабаровском крае // Дальневосточный журнал медицинской патологии. – 2010. - № 17. – С. 143-147. (http://elibrary.ru/item.asp?id=15276165)
  17. Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А. Микробиологический молекулярно-генетический мониторинг за возбудителями кишечных инфекций как составная часть эпидемиологического надзора // Бюллетень Сибирского Отделения Российской Академии Медицинских Наук. – 2011. – № 4. – С. 100-106. (http://www.soramn.ru/Journal/2011/N4/2011_4rus.htm#16
  18. Stenkova A.M., Isaeva M.P., Shubin F.N., Rasskazov V.A., Rakin A.V. Trends of the Major Porin Gene (ompF) Evolution: Insight from the Genus Yersinia // PLoS ONE. – 2011. – 6(5): e20546. (http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0020546)
  19. Бузолева Л. С., Сомов Г. П. К вопросу об эпидемиологической опасности хранения пищевых продуктов при низкой температуре. Гигиена и санитария.  2000. № 3.  - С. 31-34.
  20. Бузолева Л. С. Некультивируемые формы бактерий Yersinia pseudotuberculosis     при       периодическом культивировании // Бюлл. экспер. биологии и медицины. 2000.  Т. 129.  № 4.  С. 444-447. http://elibrary.ru/item.asp?id=21742801
  21. Сомов Г. П., Бузолева Л. С., Зайцева Е. А., Терехова В. Е. Две позиции по вопросу о возможности существования патогенных бактерий в окружающей среде // Вестник ДВО РАН.  2000. № 3 - С. 3-9.
  22. Бузолева Л.С., Сидоренко М.Л. Влияние органических веществ гуминовых кислот на размножение энтеробактерий // Журн. микробиол. 2001.  № 2. С. 89 – 91.
  23. Бузолева Л.С., Сидоренко М.Л. Влияние газообразных метаболитов почвенных бактерий на размножение Listeria monocytogenes и Yersinia pseudotuberculosis. Журн. микробиол. 2005.  №2. С .7-11.
  24. Бузолева Л.С., Кривошеева А.М., Исаченко А.С., Сомова Л.М., Сомов Г.П. Влияние температуры на синтез полифосфатов у Yersinia pseudotuberculosis и Listeria monocytogenes в условиях голодания // Биохимия. 2006. Т. 71. 4. С.541-545. http://elibrary.ru/item.asp?id=9194793
  25. E. Zaytseva, S. Ermolaeva, G.P. Somov. «Low genetic diversity and epidemiological significance of Listeria monocytogenes isolated from wild animals in the Far East of Russia.  Infect. Genet. Evol.  2007.  V. 7 (6).  P. 736 - 742.
  26. Зайцева Е.А., Ермолаева С.А., Сомов Г.П. Распространение Listeria monocytogenes среди мышевидных грызунов на территории Приморского края // Тихоокеанский мед. журнал. 2008. № 2. С. 65 - 69. http://elibrary.ru/item.asp?id=11618066
  27. Цветкова Н.Б., Бузолева Л.С. Влияние условий хранения на изменение биологических свойств Listeria monocytogenes, контаминирующих пищевые продукты» // Тихоокеанский медицинский журнал. 2010. № 4. С. 30-33. http://elibrary.ru/item.asp?id=16753683
  28. Терехова В.Е. Соснин В.А., Бузолева Л.С., Шакиров Р.Б.  Распространение бактерий Listeria monocytogenes  в западной части Охотского моря //  Океанология.  2010.  Т. 50  2 .  С. 230- 235. http://elibrary.ru/item.asp?id=13725343
  29. Бузолева Л.С., Терехова В.Е., Кривошеева А.М., Айздайчер Н.А. Влияние экзометаболитов морских микроводорослей  на размножение патогенных бактерий // Журн. микробиол. 2010  № 2.  С. 99 – 101.
  30. Сидоренко М.Л., Бузолева Л.С. Влияние летучих метаболитов прорастающих семян на размножение бактерий Listeria monocytogenes   и Yersinia pseudotuberculosis // Прикладная биохимия и микробиология. 2012. Т.48. №3. С. 308 -312. http://elibrary.ru/item.asp?id=17727125
  31. Бузолева Л.С. Сапрозоонозы: вчера, сегодня, завтра  // Бюллетень СО РАМН . 2011. 4. С.64-72. http://elibrary.ru/item.asp?id=16655005
  32. Сидоренко М.Л., Бузолева Л.С. Размножение патогенной микрофлоры под влиянием микробного сообщества почвенной экосистемы.  Вестник КрасГАУ.  2012. №3.  С.43-48. http://elibrary.ru/item.asp?id=17637013
  33. Бузолева Л.С., Ли Н.Г., Сидоренко М.Л. Взаимодействие сапрофитной микрофлоры с возбудителями сапрозоонозов в почвенных биоценозах // Успехи современного естествознания. 2013.  № 5. С. 10-12.
  34. Бузолева Л.С.  Обоснование комплексной оценки влияния факторов окружающей среды на патогенные свойства листерий, контаминирующих пищевые продукты // Международный журнал экспериментального образования. 2013. № 8. С.71-74.  http://elibrary.ru/item.asp?id=21105885
 

 

 

 

         
 
Карта сайта
 
НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова © 2012-2018                             Создание сайтов
 
вверх