НИИЭМ  


telephone
  2gisг. Владивосток, Сельская, 1

 
img
 

 

Главная страница

Научно-организационная
деятельность

Интеллектуальная
собственность

Образовательная
деятельность

Инновационная
деятельность

Дополнительные виды
деятельности

Официальные документы

Контакты

Вакансии

 

 

 

Лабратория молекулярной эпидемиологии и экологии патогенных бактерий

         Руководитель лаборатории - Яковлев Анатолий Александрович,Яковлев А.А.
ведущий научный сотрудник, доктор медицинских наук, профессор.

 

 

 

 

Телефон: 8 (423) 244-14-88,
e-mail: yakovlev-epid@yandex.ru

 

        Лаборатория была создана в 2018 году при объединении существующих ранее лаборатории Молекулярной эпидемиологии и лаборатории Экологии патогенных бактерий. Основателями лабораторий были д.м.н., профессор, академик РАН Г.П. Сомов и д.м.н., профессор Ф.Н. Шубин.

Сотрудники лаборатории

Раков Алексей Владимирович - старший научный сотрудник, кандидат медицинских наук, e-mail: vokar@mail333.com
Кузнецова Наталья Анатольевна - старший научный сотрудник, кандидат медицинских наук, e-mail: kuznetsovanata@mail.ru
Пономарева Анна Леонидовна - научный сотрудник, e-mail: giston@list.ru
Еськова Алена Игоревна - младший научный сотрудник, e-mail: gosha30245@mail.ru
Белкина Раиса Анатольевна - лаборант-исследователь.
Обухова Вера Степановна - лаборант-исследователь.

Направления научных исследований

• Внутривидовые и межвидовые коммуникации микроорганизмов.
• Микробные ассоциации в морских биоценозах.
• Биотические и абиотические факторы в реализации эпидемического потенциала возбудителей сапрозоонозов.
• Механизмы ассоциации патогенных микроорганизмов с нормальной микрофлорой в микробиоценозах биотопов пищеварительной системы.
• Исследование механизмов биопленкообразования патогенных бактерий, вызывающих хронические заболевания человека, и ассоциированных с ними микроорганизмов нормальной микрофлоры.
• Скрининиг веществ, препятствующих биопленкообразованию патогенных бактерий.
• Микробиологический молекулярно-генетический мониторинг за возбудителями кишечных инфекций.

Основные достижения лаборатории

• В лаборатории молекулярной эпидемиологии впервые в России стали проводиться молекулярно-генетические исследования возбудителя псевдотуберкулеза, которые внесли вклад в развитие нового научного направления - молекулярной эпидемиологии. Теоретические положения позволили разработать и внедрить на территории Сибири и Дальнего Востока технологию централизованного микробиологического молекулярно-генетического мониторинга за сальмонеллами, открывающую перспективу для централизованного слежения за возбудителями бактериальных инфекций на территории Российской Федерации.
• Изучены механизмы адаптации возбудителей сапрозоонозов к абиотическим факторам окружающей среды, включающее исследование биологических свойств и генетической структуры популяций возбудителей сапрозоонозов в условиях антропогенного загрязнения эндемичных территорий, и биотическим факторам в направлении исследования действия регуляторных сигналов на размножение патогенных бактерий в процессах межклеточной коммуникации.
• Изучены механизмы циркуляции возбудителя листериоза на территории Дальнего Востока, выявление новых генетических вариантов возбудителя листериоза, имеющих эпидемиологическое и эпизоотологическое значение.
• Усовершенствована лабораторная диагностики сапрозоонозов на основе разработок новых тест-систем, дифференциально-диагностических и питательных сред с использованием дальневосточного сырья.
• Раскрыты некоторые адаптационные биохимические механизмы, сформировавшиеся у Yersinia pseudotuberculosis и Listeria monocytogenes, в процессе адаптации популяций этих патогенных бактерий к изменяющимся условиям окружающей среды. Показано, что популяционная изменчивость возбудителей сапрозоонозов является адаптивной реакцией бактерий при смене сред обитания и носит фенотипический характер, что позволяет им сохраняться как биологическим видам в разных условиях обитания.
• Разработана комплексная система микробиологического и молекулярно-генетического мониторинга за возбудителем листериоза, L.monocytogenes, включающая: экспресс-методы выявления и идентификации возбудителя листериоза, основанные на ПЦР, специфичной в отношении консервативных фрагментов генов патогенности, кодирующих белки-интерналины, использование адаптированных и оптимизированных для отечественных условий методов микробиологической дифференциации листерий и систему типирования L.monocytogenes на основе мультилокусного секвенирования генов факторов патогенности. Разработанная система позволяет дифференцировать эпидемически несвязанные между собой изоляты листерий и обеспечивать проведение систематического анализа и прогнозирование заболеваемости этой инфекцией.
        За годы работы лабораторий были выполнены и защищены 3 докторские и 12 кандидатских диссертаций, опубликовано 10 монографий, получено 2 авторских свидетельства, 7 патентов на изобретения и 10 свидетельств о регистрации баз данных.
        В настоящее время в штате лаборатории 5 научных сотрудников: 1 доктор наук, 3 кандидата наук и младший научный сотрудник без степени.

На договорной основе в лаборатории выполняются:

  • Бактериологическая диагностика листериоза.
  • Определение чувствительности к антибиотикам штаммов микроораганизмов.
  • Мониторинговые исследования санитарно-микробиологического состояния морских вод и почв.
  • Мониторинговые исследования эколого-микробиологического состояния сред обитания на основе сравнительных исследований численности бактерий разных физиологических групп.
  • Консультативно-методическая помощь.

Основные монографии

  • Сомова Л.М., Бузолева Л.С., Плехова Н.Г. Ультраструктура патогенных бактерий в разных экологических условиях. Владивосток: Медицина ДВ, 2009. 200 с.
  • Бузолева Л.С. Санитарно-микробиологическая оценка и источники микробного загрязнения прибрежных морских вод Глава в монографии «Современное экологическое состояние залива Петра Великого Японского моря», Владивосток, Издательский дом Дальневосточного Федерального ун-та. 2012. 190 с. С. 48-72.
  • Сидоренко М.Л. Бузолева Л.С. Адаптация патогенных бактерий к абиотическим и биотическим факторам почв Монография Изд-во: МГУ им. Невельского. Редактор профессор Н.М. Костенков. 2013. 232 с.
  • Sidorenko M. L., Buzoleva L.S. The effect of soil abiotic and biotic factors on the preservation and reproduction of Listeria monocytogenes Глава в монографии «Listeria monocytogenes: food sources, prevalence and management strategies». Ed.: Edmund C. Hambrick. - Nova Science Publishers, New York. 2014 P. 231-264.

Учебные пособия

  • Бузолева Л.С. Микробиологическая оценка качества природных вод, учебное пособие, Владивосток: Из-дат-во МГУ им. Невельского, 2011. 85 с.
  • Бузолева Л.С., Безвербная И.П. Влияние тяжелых металлов на физиологию и морфологию морских микроорганизмов. Атлас, учебное пособие, Владивосток: Изд-во: Дальневост. федерального ун-та, 2012. 72 с.
  • Бузолева Л.С., Белькова Н.Л. Методики для практических работ по большому микробиоло-гическому практикуму, учебное пособие, Владивосток: Изд-во Морской государственный университет им. Адм. Г.И. Невельского, 2012. 48 с.

Основные статьи последних лет

  1. Кузнецова Н.А., Шубин Ф.Н., Раков А.В., Тарасенко Т.Т., Воронок В.М., Смирнова Л.А. Связь вспышечной и спорадической заболеваемости сальмонеллезом по соответствию плазмидных характеристик возбудителей // Тихоокеанский медицинский журнал. – 2010. – № 4. – С. 40-42. http://www.tmj-vgmu.ru/files/old/PMJ_2009-2011/1773.pdf
  2. Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А. Микробиологический молекулярно-генетический мониторинг за возбудителями кишечных инфекций как составная часть эпидемиологического надзора // Бюллетень Сибирского Отделения Российской Академии Медицинских Наук. – 2011. – № 4. – С. 100-106. http://sibmed.net/archive/2011/4_2011rus.zip
  3. Раков А.В., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А. Гетерогенность плазмид молекулярной массой 1,4 МДа в штаммах Salmonella Enteritidis // Бюллетень СО РАМН. - 2013. - Т. 33. - № 2. - С. 10-15. http://sibmed.net/article.php?lang=rus&id_article=209
  4. Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А., Матосова Е.В. Зоонозный сальмонеллез на Дальнем Востоке: основные аспекты проблемы // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2015. - № 29 (29). - С. 75-82. https://elibrary.ru/item.asp?id=25809022
  5. Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А., Якубич Т.В., Снеткова И.П. Формирование заболеваемости населения сальмонеллезом, вызванным Salmonella Enteritidis, в районах с неполным обеспечением населения местной продукцией птицеводства // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2017. - № 1. - С. 61-67. https://elibrary.ru/item.asp?id=32586844
  6. Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Раков А.В., Соловьева А.С. Особенности молекулярной эпидемиологии завозной заболеваемости населения сальмонеллёзом, вызванным отдельными плазмидными типами Salmonella Enteritidis // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2018. - Т. 23. - № 2. - С. 73-76. https://elibrary.ru/item.asp?id=35285061
  7. Кузнецова Н.А., Шубин Ф.Н., Раков А.В., Яковлев А.А. Молекулярно-эпидемиологическая оценка влияния процессов глобализации на формирование популяции Salmonella Typhimurium в Приморском крае и других субъектах Сибири и Дальнего Востока // Тихоокеанский медицинский журнал. - 2018. - № 3. - С. 47-53. http://tmj-vgmu.ru/index.php/ru/2018-god/3-73/1659-molekulyarno-epidemiologicheskaya-otsenka-vliyaniya-protsessov-globalizatsii-na-formirovanie-populyatsii-salmonella-typhimurium-v-primorskom-krae-i-drugikh-sub-ektakh-sibiri-i-dalnego-vostoka
  8. Раков А.В., Кузнецова Н.А., Соловьева А.С., Яковлев А.А. Кластерный анализ популяций Salmonella Enteritidis, выделенных в различных регионах Сибири и Дальнего Востока // Тихоокеанский медицинский журнал. – 2018. - № 4. – С. 66-69.
  9. Бузолева Л.С., Терехова В.Е., Кривошеева А.М., Айздайчер Н.А. Влияние экзометаболитов морских микроводорослей на размножение патогенных бактерий // Журн. микробиол. 2010 № 2. С. 99 – 101. https://elibrary.ru/item.asp?id=21142734
  10. Сидоренко М.Л., Бузолева Л.С. Влияние летучих метаболитов прорастающих семян на размножение бактерий Listeria monocytogenes и Yersinia pseudotuberculosis // Прикладная биохимия и микробиология. 2012. Т.48. №3. С. 308 -312. http://elibrary.ru/item.asp?id=17727125
  11. Журн. микробиол. – 2006. – № 3. (Приложение) – С. 28-32. (http://elibrary.ru/item.asp?id=9213419)
  12. Бузолева Л.С. Обоснование комплексной оценки влияния факторов окружающей среды на патогенные свойства листерий, контаминирующих пищевые продукты // Международный журнал экспериментального образования. 2013. № 8. С.71-74. http://elibrary.ru/item.asp?id=21105885
  13. Бузолева Л.С., Ким А.В., Компанец Г.Г, Богатыренко Е.А. Проявление патогенных свойств у морских бактерий под влиянием антропогенного загрязнения // Экология человека. 2016. № 3. С. 30-36.
  14. Buzoleva L.S., Tsvetkova N.B., Bogatyrenko E.A. Biofilm formation by different serological variants of Listeria monocytogenes in association with Bacillus pumilus // Microbiology. 2016. V. 85, № 3. P. 311–316.
  15. Buzoleva L.S., Bogatyrenko Ye.A., Yes'Kova A.I., Kim A.V., Dolmatova Ye.S., Golozubova Yu.S. Taxonomic composition and ecological and trophic structure of bacterial communities of the coastal areas of water of the sea of japan differing in the intensity of anthropogenic load // Hydrobiological Journal. 2016. Т. 52. № 6. С. 66-74.
 

 

 

 

         
 
Карта сайта
 
НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова © 2012-2018                             Создание сайтов
 
вверх